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海軍新一代飛彈巡防艦（小神盾艦）從原構想4500噸調整到5500噸的船體儎台設計，雖海軍初步計算可完全容納中科院研製「迅聯艦用作戰系統」，據指出，中科院研製「艦載式相列雷達」，體積與重量都比歐美系統要大了一些，世界各國設計現役具有神盾系統的飛彈巡防艦，多在6000噸以上，中科院強烈建議海軍，小神盾艦基本設計在6200噸，是比較有足夠空間來容納所有作戰系統與裝備。
中科院「迅聯艦用戰鬥系統」設計的整體規畫，是以開放式指管系統為核心，依各項作戰任務之不同，結合特定武器、偵蒐裝備與通信設備，即可組成作戰艦艇所需的戰鬥系統。開放式指管系統作為管制決策中心，整合偵蒐力與打擊力，成為完整的攻擊／防禦載台，並整合資通力與資料庫，成為國軍防衛體系這個大系統下的子系統，以執行聯合作戰。因此這套系統所需要的空間也比過去海軍艦用作戰系統要更多。
但從2017年台北國際航太暨國防工業展中，海軍展示「新一代飛彈巡防艦」的模型中，並不是走向大型的神盾艦，例如美軍神盾艦都是9000噸以上，而使用美國製造神盾系統外銷型的國家，包括日本金剛級、愛宕級護衛艦排水量都在7000噸以上，韓國的世宗大王級驅逐艦也有7600噸。

小神盾艦噸位需升級　關鍵在中科院自製雷達


而走向歐洲各國海軍發展、具有相列雷達結合MK-41垂直發射系統的神盾系統的飛彈巡防艦，例如英國Type-45勇敢級飛彈驅逐艦、法國與意大利合作生產的「水平線」飛彈驅逐艦、德國F－124型飛彈巡防艦、荷蘭「七省」級飛彈護衛艦，而這些神盾艦外型的特色是把相列雷達放置在船艦最高的位置，但噸位也都在6000噸以上。
據指出，就因為海軍小神盾艦設計是走向歐洲海軍的方向，但中科院自制的相列雷達系統體積比較大，因此在設計時就必須考慮用更大空間來安裝，是比較安全且實際的作法，畢竟首艘的原型艦要進行各項測試，先將所有規劃的系統都安裝上去測試，未來再依各項需求來調整修正；不要因空間不足裝不下全裝備，造成未來測試上的不便，恐怕也無法滿足迅聯艦用作戰系統的需求。